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DOI:10.18129 / B9.bioc.recoup
此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见收回．
一个R包，用于创建复杂的基因组剖面图
Bioconductor版本:3.7
recop计算并绘制从下一代测序技术获得的短序列读取的信号剖面。所提供的概况是概括的曲线概况或热图概况。目前，recop支持从ChIP-Seq和RNA-Seq实验中读取的基因组轮廓图。该包使用ggplot2和ComplexHeatmap图形工具分别用于曲线和热图覆盖概要文件。
作者:Panagiotis Moulos < Moulos at fleming.gr>
维护者:Panagiotis Moulos < Moulos at fleming.gr>
引文(从R内，输入引用(“收回”))：
安装
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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“补偿”)
文档
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browseVignettes(“收回”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 补偿包的介绍 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | ChIPSeq，报道，GeneExpression，预处理，质量控制，RNASeq，测序，软件 |
| 版本 | 1.8.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.3 (R-3.3)(2.5年) |
| 许可证 | GPL (>= 3) |
| 取决于 | R (>= 2.13.0)，GenomicRanges，GenomicAlignments，ggplot2，ComplexHeatmap |
| 进口 | BiocGenerics，biomaRt，circlize，图形，grDevices，方法，rtracklayer，plyr，统计，效用 |
| 链接 | |
| 建议 | 网格,GenomeInfoDb，Rsamtools，BiocStyle，knitr，rmarkdown，动物园，RUnit，BiocInstaller，BSgenome，RSQLite，RMySQL |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | 平行 |
| URL | https://github.com/pmoulos/recoup |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | recoup_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | recoup_1.8.0.zip |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | recoup_1.8.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/recoup |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ recop |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/recoup/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
