rWikiPathways

DOI:10.18129 / B9.bioc.rWikiPathways

这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅rWikiPathways。

rWikiPathways - R WikiPathways API客户端库

Bioconductor版本:3.7

使用这个包与WikiPathways API接口。

作者:大多Willighagen (aut (cre) (< https://orcid.org/0000 - 0001 - 7542 - 0286 >),亚历克斯Pico (aut) (< https://orcid.org/0000 - 0001 - 5706 - 2163 >)

维护人员:大多Willighagen <大多。willighagen gmail.com >,亚历山大Pico < alex。pico gladstone.ucsf.edu >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“rWikiPathways”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“rWikiPathways”)

HTML	R脚本	1。概述
HTML	R脚本	2。rWikiPathways和BridgeDbR
HTML	R脚本	3所示。rWikiPathways和RCy3
HTML	R脚本	4所示。路径分析
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	GraphAndNetwork,代谢组学,网络,软件,ThirdPartyClient,可视化
版本	1.0.5
许可证	麻省理工学院+文件许可
取决于	R (> = 3.5)
进口	caTools,httr,RJSONIO,跑龙套
链接
建议	testthat,BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/wikipathways/rwikipathways
BugReports	https://github.com/wikipathways/rwikipathways/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	rWikiPathways_1.0.5.tar.gz
Windows二进制	rWikiPathways_1.0.5.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	rWikiPathways_1.0.5.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rWikiPathways
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rWikiPathways
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rWikiPathways/
包下载报告	下载数据