rTANDEM

DOI:10.18129 / B9.bioc.rTANDEM

这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅rTANDEM。

接口串联蛋白质识别算法在R

Bioconductor版本:3.7

这个包接口串联蛋白质识别算法在r .识别可以在X !串联风格,通过使用作为唯一参数参数文件的路径。但rTANDEM也提供了扩展语法和功能来简化发射分析,以及功能转换结果,参数和分类从r /相关的包,shinyTANDEM为结果提供了可视化的界面对象。

作者:弗雷德里克·弗尔涅<弗雷德里克。弗尔涅在crchuq.ulaval.ca >,Charles Joly Beauparlant , Rene Paradis , Arnaud Droit

维护人员:弗雷德里克·弗尔涅<弗雷德里克。弗尔涅在crchuq.ulaval.ca >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“rTANDEM”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“rTANDEM”)

PDF	R脚本	rTANDEM用户指南
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	MassSpectrometry,蛋白质组学,软件
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(5.5年)
许可证	艺术- 1.0 |文件许可
取决于	XML,Rcpp,data.table(> = 1.8.8)
进口	方法
链接	Rcpp
建议	biomaRt
SystemRequirements	rTANDEM使用外籍人士和pthread库。有关详细信息,请参阅README文件。
增强了
URL
取决于我	PGA,sapFinder,shinyTANDEM
进口我	proteoQC
建议我	RforProteomics
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	rTANDEM_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	rTANDEM_1.20.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	rTANDEM_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rTANDEM
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rTANDEM
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rTANDEM/
包下载报告	下载数据