rSFFreader

DOI:10.18129 / B9.bioc.rSFFreader

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见rSFFreader．

rSFFreader读取由罗氏454和生命科学离子激流测序器生成的sff文件

Bioconductor版本:3.7

rSFFreader读取序列，质量和剪辑点值从sff文件生成的罗氏454和生命科学离子激流测序器到类似的类为fastq文件。

作者:Matt settle ， Sam Hunter, Brice Sarver, Ilia Zhbannikov, Kyu-Chul Cho

维护者:Matt settle

安装

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文档

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PDF	R脚本	rSFFreader的介绍
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，测序，软件
版本	0.28.0
在Bioconductor	BioC 2.11 (R-2.15)(6年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	ShortRead(> = 1.23.17)
进口	方法,Biostrings，IRanges
链接	S4Vectors(> = 0.13.8),IRanges，XVector，Biostrings
建议	xtable
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	hiReadsProcessor
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	rSFFreader_0.28.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	rSFFreader_0.28.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rSFFreader
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rSFFreader
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rSFFreader/
软件包下载报告	下载数据