qpgraph

doi:10.18129/b9.bioc.qpgraph

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅qpgraph

从高通量基因组数据数据中估计遗传和分子调节网络

生物导体版本:3.7

从高通量表达和基因分型测定中估算基因和EQTL网络。

作者:Robert Castelo [AUT,CRE],Alberto Roverato [AUT]

维护者:Robert Castelo

引用(从r内,输入引用(“ qpgraph”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ qpgraph”)

文档

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PDF basicusersguide.pdf
PDF R脚本 使用QPGraph估算EQTL网络
PDF R脚本 使用QPGraph的反向工程转录调节网络
PDF R脚本 使用QPGraph模拟分子调节网络
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 基因表达,,,,结肠管制,,,,遗传因素,,,,遗传学,,,,GraphandNetwork,,,,微阵列,,,,网络引导,,,,途径,,,,SNP,,,,软件,,,,转录
版本 2.14.0
在生物导体中 Bioc 2.4(R-2.9)(9。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 3.4)
进口 方法,并行,矩阵(> = 1.0),网格,注释,,,,图形(> = 1.45.1),生物酶,,,,S4VECTORS,,,,生物比较,,,,AnnotationDbi,,,,iranges,,,,GenomeInfodB,,,,基因组机,,,,GenomicFeatures,,,,mvtnorm,,,,QTL,,,,rgraphviz
链接
建议 运行,,,,生物基因,,,,生物使用,,,,GeneFilter,,,,org.eck12.eg.db,,,,Rlecuyer,,,,,,,,类别,,,,gostats
系统要求
增强
URL https://github.com/rcastelo/qpgraph
BugReports https://github.com/rcastelo/rcastelo/issues
取决于我
进口我 快船
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 qpgraph_2.14.0.tar.gz
Windows二进制 qpgraph_2.14.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) qpgraph_2.14.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qpgraph
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/qpgraph
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/qpgraph/
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