这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅philr。
Bioconductor版本:3.7
PhILR是系统发育等距Log-Ratio变换。这个包提供了功能成分的分析数据(例如,数据代表的比例不同的变量/部分)。特别是这个包允许成分分析数据可以通过一个系统发育树相关的部分(如微生物群是常见的调查数据)并使之可用等距日志比例变换从系统发育树构建和利用加权参考措施。
作者:贾斯汀·西尔弗曼
维护人员:贾斯汀Silverman < jsilve24 gmail.com >
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HTML | R脚本 | 介绍PhILR |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 宏基因组,微生物组,测序,软件 |
版本 | 1.6.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.4 (r - 3.3)(2年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | |
进口 | 猿,phangorn,tidyr,ggplot2,ggtree |
链接 | |
建议 | testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle,phyloseq,glmnet,dplyr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/jsilve24/philr |
BugReports | https://github.com/jsilve24/philr/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | philr_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | philr_1.6.0.zip |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | philr_1.6.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/philr |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ philr |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/philr/ |
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