phantasus

DOI:10.18129 / B9.bioc.phantasus

这个包是用于Bioconductor 3.7版的;有关稳定的最新发布版本，请参阅phantasus。

视觉和交互基因表达分析

Bioconductor版本:3.7

Phantasus是一个用于可视化和交互式基因表达分析的web应用程序。Phantasus是基于Morpheus的，Morpheus是一个基于网络的热图可视化和分析软件，通过OpenCPU API与R环境集成。除了基本的可视化和过滤方法外，还支持基于r的方法，如使用limma包进行k-means聚类、主成分分析或差分表达式分析等。

作者:Daria Zenkova [aut]， Vladislav Kamenev [aut]， Maxim Artyomov [aut]， Alexey Sergushichev [aut, cre]

维护者:Alexey Sergushichev

安装

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## #尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“phantasus”)

文档

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browseVignettes(“phantasus”)

超文本标记语言	R脚本	开发新工具
超文本标记语言	R脚本	使用phantasus应用程序
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	聚类,DataRepresentation,DifferentialExpression,GUI,GeneExpression,微阵列,归一化,PrincipalComponent,RNASeq,软件,转录组,可视化
版本	1.0.2中
许可证	MIT +文件许可
取决于	R (> = 3.5)
进口	ggplot2,protolite,Biobase,GEOquery,车,htmltools,httpuv,jsonlite,limma,opencpu,为了、方法、httr,rhdf5跑龙套,平行,stringr,fgsea,svglite
链接
建议	testthat,BiocStyle,knitr,rmarkdown,data.table,svglite
SystemRequirements
增强了
URL	https://genome.ifmo.ru/phantasushttps://artyomovlab.wustl.edu/phantasus
BugReports	https://github.com/ctlab/phantasus/issues
取决于我
进口我
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包档案

遵循bob 体育网址 在你的R会话中使用这个包的说明。

源包	phantasus_1.0.2.tar.gz
Windows二进制	phantasus_1.0.2.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	phantasus_1.0.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/phantasus
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ phantasus
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/phantasus/
包下载报告	下载数据