这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅perturbatr。
Bioconductor版本:3.7
perturbatr级间分析大规模遗传扰动屏幕集成数据集组成的多个屏幕。为多个集成微扰屏幕之间的层次结构模型,该模型考虑了方差不同生理条件下安装。基因影响的结果列表然后进一步扩展使用网络传播算法对假阴性。
作者:西蒙Dirmeier (aut (cre)
维护人员:西蒙Dirmeier <西蒙。在web.de dirmeier >
从内部引用(R,回车引用(“perturbatr”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“perturbatr”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“perturbatr”)
HTML | R脚本 | perturbatr食谱 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CellBasedAssays,网络,回归,软件 |
版本 | 1.0.0 |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R(> = 3.5),方法,统计数据 |
进口 | dplyr,ggplot2,tidyr,为了,lme4样条函数,igraph,foreach平行,doParallel,diffusr,lazyeval,宠物猫、网格跑龙套、图形尺度,magrittr,formula.tools,rlang |
链接 | |
建议 | testthat,lintr,knitr,rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/cbg-ethz/perturbatr |
BugReports | https://github.com/cbg-ethz/perturbatr/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | perturbatr_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | perturbatr_1.0.0.zip |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | perturbatr_1.0.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/perturbatr |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ perturbatr |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/perturbatr/ |
包下载报告 | 下载数据 |