pcamethods

doi:10.18129/b9.bioc.pcamethods

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅pcamethods

PCA方法的集合

生物导体版本:3.7

提供贝叶斯PCA,概率PCA,NIPALS PCA,逆非线性PCA和常规SVD PCA。包括基于群集的基于群集的方法进行比较。BPCA,PPCA和NIPALSPCA可用于在不完整的数据上执行PCA,以及准确的缺少价值估计。还提供了一组用于打印和绘制结果的方法。所有PCA方法均使用相同的数据结构(PCARES)为PCA结果提供了共同的接口。在德国戈尔姆的Max-Planck分子植物生理学研究所发起。

作者:Wolfram Stacklies,Henning Redestig,Kevin Wright

维护者:Henning Redestig

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PDF R脚本 与异常值数据
PDF R脚本 介绍
PDF R脚本 缺少价值插补
PDF 参考手册

细节

生物浏览 贝叶斯,,,,软件
版本 1.72.0
在生物导体中 Bioc 1.9(R-2.4)(12年)
执照 GPL(> = 3)
要看 生物酶, 方法
进口 生物基因,,,,RCPP(> = 0.11.3),大量的
链接 RCPP
建议 矩阵,,,,格子,,,,GGPLOT2
系统要求 RCPP
增强
URL https://github.com/hredestig/pcamethods
BugReports https://github.com/hredestig/pcamethods/issues
取决于我 deconrnaseq
进口我 compgo,,,,达帕尔,,,,MSNBase,,,,Panvizgenerator,,,,SCDE,,,,躯体签名
建议我 mtbls2
链接到我
构建报告

包装档案

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源包 pcamethods_1.72.0.tar.gz
Windows二进制 pcamethods_1.72.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) pcamethods_1.72.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pcamethods
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/pcamethods
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/pcamethods/
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