逆口

DOI：10.18129 / b9.bioc.oppar.

此套餐适用于Biocumonds 3.7版;对于稳定的最新版本版本，请参阅逆口。

r的异常概况和路径分析

生物导体版本：3.7

Wang等人发布的McOPA包的R.（2012）。oppar提供癌症异常分析分析的方法。虽然最初开发用于检测癌症研究中的异常基因，但在oppar中呈现的方法可用于总体的异常配置文件分析。此外，还提供了基因设定富集和途径分析的工具。

作者：Chenwei Wang [Aut]，Alperen Taciroglu [Aut]，Stefan R Maetschke [Aut]，Colleen C Nelson [Aut]，Mark Ragan [Aut]，Melissa Davis [Aut]，Soroor Hediyehzadeh [Cre]，Momeneh Foroutan [CTR]

维护者：SOROOR HEDIYEHZADEH

安装

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##尝试http：//如果不支持https：// url source（“https://biocumon.org/bioclite.r”）Bioclite（“oppar”）

文件

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Browsevignettes（“oppar”）

HTML.	r script.	oppar：r的异常概况和途径分析
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	基因表达那GenesetenRichment.那途径那软件那系统生物学
版本	1.8.0.
在生物导体中以来	BIOC 3.3（R-3.3）（2.5岁）
执照	GPL-2
依靠	r（> = 3.3）
进口	BioBase.， 方法，GSEABASE.那GSVA.
链接到
建议	kn那RAMAMAMDOW.那林马那org.hs.eg.db.那go.db.那雪， 平行
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	Oppar_1.8.0.tar.gz.
Windows二进制文件	Oppar_1.8.0.zip.（32-＆64位）
Mac OS x 10.11（El Capitan）	Oppar_1.8.0.TGZ.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/oppar.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包装/ opar
包短网址	http://biocidodder.org/packages/oppar/
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