mzID

DOI:10.18129 / B9.bioc.mzID

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见mzID．

R的mzIdentML解析器

Bioconductor版本:3.7

使用XML包实现的mzIdentML文件解析器。解析器试图通用，能够处理所有类型的mzIdentML文件，缺点是输出比特定于供应商的解析器更“漂亮”。如果有任何问题，请与维护人员联系，并提供一个mzIdentML文件，以便快速解决问题。

作者:Thomas Lin Pedersen, Vladislav A Petyuk, Laurent Gatto和Sebastian Gibb撰稿。

维护者:Thomas Lin Pedersen

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“mzID”)

文档

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browseVignettes(“mzID”)

PDF	R脚本	使用mzID
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，MassSpectrometry，蛋白质组学，软件
版本	1.18.0
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	方法
进口	XML，plyr平行,doParallel，foreach，迭代器，ProtGenerics
链接
建议	knitr，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	蛋白质组学
进口我	MSGFgui，MSGFplus，MSnbase，MSnID，Pbase
建议我	mzR，RforProteomics
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	mzID_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	mzID_1.18.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	mzID_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mzID
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/mzID
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/mzID/
软件包下载报告	下载数据