MotifMatchr

doi:10.18129/b9.bioc.motifmatchr

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅MotifMatchr

r中的快速图案匹配

生物导体版本:3.7

快速找到许多主题和许多序列的主题匹配。由Pasi Rastas,Janne Korhonen和PetriMartinmäki开发的情绪主题库中的C ++代码。

作者:斯坦福大学艾丽西亚·施普[Aut,Cre] [CPH]

维护者:alicia schep

引用(从r内,输入引用(“ MotifMatchr”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ motifmatchr”)

文档

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browsevignettes(“ motifmatchr”)

html R脚本 MotifMatchr
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 图案,,,,软件
版本 1.2.0
执照 GPL-3 +文件许可证
要看 R(> = 3.3)
进口 矩阵,,,,RCPP, 方法,TFBSTOOLS,,,,生物弦,,,,BSGENOME,,,,S4VECTORS,,,,总结性特征,,,,基因组机,,,,iranges,,,,rsamtools,,,,GenomeInfodB
链接 RCPP,,,,rcpparmadillo
建议 测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求 C ++ 11
增强
URL
取决于我
进口我 esatac
建议我 Chromvar
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 motifmatchr_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 motifmatchr_1.2.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) motifmatchr_1.2.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/motifmatchr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/motifmatchr
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/motifmatchr/
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