macat

DOI:10.18129 / B9.bioc.macat

此包适用于Bioconductor的3.7版;有关稳定的、最新的发布版本,请参见macat

微阵列染色体分析工具

Bioconductor版本:3.7

这个库包含功能,以调查差异基因表达和染色体定位的基因之间的联系。MACAT是由常见的观察现象涉及肿瘤细胞的大染色体区域。MACAT是一种用于识别显著差异表达染色体区域的统计方法。这些功能已经在一个关于急性淋巴细胞白血病(Yeoh et al.Cancer Cell 2002)的公开数据集上进行了测试,该数据集在图书馆“stjudem”中提供。

作者:Benjamin Georgi, Matthias Heinig, Stefan Roepcke, Sebastian Schmeier, Joern Toedling

维护者:Joern Toedling

引文(从R中输入引用(“macat”)):

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“macat”)

文档

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PDF R脚本 微阵列染色体分析工具
PDF 参考手册

细节

biocViews DifferentialExpression微阵列软件可视化
版本 1.54.0
Bioconductor自 BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 13.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 Biobase注释
进口
链接
建议 hgu95av2.dbstjudem
SystemRequirements
增强了
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取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

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源包 macat_1.54.0.tar.gz
Windows二进制 macat_1.54.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) macat_1.54.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/macat
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ macat
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/macat/
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