此包适用于Bioconductor的3.7版;有关稳定的、最新的发布版本,请参见macat.
Bioconductor版本:3.7
这个库包含功能,以调查差异基因表达和染色体定位的基因之间的联系。MACAT是由常见的观察现象涉及肿瘤细胞的大染色体区域。MACAT是一种用于识别显著差异表达染色体区域的统计方法。这些功能已经在一个关于急性淋巴细胞白血病(Yeoh et al.Cancer Cell 2002)的公开数据集上进行了测试,该数据集在图书馆“stjudem”中提供。
作者:Benjamin Georgi, Matthias Heinig, Stefan Roepcke, Sebastian Schmeier, Joern Toedling
维护者:Joern Toedling
引文(从R中输入引用(“macat”)
):
要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“macat”)
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browseVignettes(“macat”)
R脚本 | 微阵列染色体分析工具 | |
参考手册 |
biocViews | DifferentialExpression,微阵列,软件,可视化 |
版本 | 1.54.0 |
Bioconductor自 | BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 13.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | Biobase,注释 |
进口 | |
链接 | |
建议 | hgu95av2.db,stjudem |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | macat_1.54.0.tar.gz |
Windows二进制 | macat_1.54.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | macat_1.54.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/macat |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ macat |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/macat/ |
包下载报告 | 下载数据 |