mCSEA

DOI:10.18129 / B9.bioc.mCSEA

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见mCSEA．

甲基化CpGs集富集分析

Bioconductor版本:3.7

使用Illumina的450K或EPIC微阵列数据从人类基因组中识别预定义区域(启动子，CpG岛…)中的差异甲基化区域(DMRs)。提供基于线性模型对CpG探针进行排序的方法，并包括绘图函数。

作者:Jordi Martorell-Marugán和Pedro Carmona-Sáez

维护者:Jordi Martorell-Marugán

安装

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文档

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PDF	R脚本	预定义的DMRs识别与mCSEA包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DNAMethylation，DifferentialMethylation，表观遗传学，遗传学，GenomeAnnotation，MethylationArray，微阵列，MultipleComparison，软件，TwoChannel
版本	1.0.1
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.5)，mCSEAdata，Homo.sapiens
进口	fgsea，GenomicFeatures，GenomicRanges，ggplot2，图形，grDevices，Gviz，IRanges，limma平行,S4Vectors统计数据,SummarizedExperiment,跑龙套
链接
建议	Biobase，BiocGenerics，BiocStyle，knitr，leukemiasEset，rmarkdown，RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

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源包	mCSEA_1.0.1.tar.gz
Windows二进制	mCSEA_1.0.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	mCSEA_1.0.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mCSEA
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/mCSEA
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/mCSEA/
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