林马

DOI：10.18129 / b9.bioc.limma.

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微阵列数据的线性模型

生物导体版本：3.7

微阵列数据的数据分析，线性模型和差异表达。

作者:Gordon Smyth [cre,aut]， Yifang Hu [ctb]， Matthew Ritchie [ctb]， Jeremy Silver [ctb]， James Wettenhall [ctb]， Davis McCarthy [ctb]， Di Wu [ctb]， Wei Shi [ctb]， Belinda Phipson [ctb]， Aaron Lun [ctb]， Natalie Thorne [ctb]， Alicia Oshlack [ctb]， Carolyn de Graaf [ctb]， Yunshun Chen [ctb]， Mette Langaas [ctb]， Egil Ferkingstad [ctb]，Marcus Davy, Francois Pepin, Dongseok Choi

维护者：Gordon Smyth

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Biocviews.	替代品那BatchEffect那贝叶斯那聚类那DataImport.那不同的亚兴那差异化那Exonarray.那基因表达那GenesetenRichment.那遗传学那microRNAARRAY.那微阵列那多匹匹莫森那正常化那oneChannel.那预处理那proprietaryplatforms.那QualityControl.那rnaseq.那回归那测序那软件那TimeCourse那转录那两种通道那MRAMICRARARAY.
版本	3.36.5
在生物导体中以来	BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 13.5年)
执照	GPL（> = 2）
依靠	r（> = 2.3.0）
进口	Grdevices，图形，统计数据，Util，方法
链接到
建议	affy那annotationdbi.那百瑞德那Biobase那椭圆那GO.db那贡献那Illuminaio.那Locfit.那大量的那org.hs.eg.db.，花键，Statmod.（> = 1.2.2），VSN.
SystemRequirements
加强
URL.	http://bioinf.wehi.edu.au/limma.
取决于我	A4Base.那yeasyExpress那Agimicrorna.那比希拉那BLMA那索布尔那CCL4.那CGHMCR.那ChimpHumanBrainData那Clippda.那Codelink.那兑换那cormotif那药物潜行酶那刨边机那EGSEA123那eximir.那ExpressionAtlas那有限元法那fletcher2013a.那GCMAP.那Genefu.那HD2013SGI那htqpcr.那maigespack.那maPredictDSC那马拉莱那metagenomeSeq那metaseqr.那甲基疗法arrayAlysis.那mmpalatemirna.那MPRA.那PGPC.那PROT2D.那QPcrnorm.那QUusage.那rbm.那林诺那RNAseq123那rnbeads.那rnits.那simpleSingleCell那snapcgh.那泼丝体那SRGNET.那SSPA.那翻译那马托姆大陆那variancepartition.那西瓜
进口我	ABSSEQ.那倍感工具那聘请圭圭那Anamir.那Anota2seq.那ArrayExpress.那ressquality.那ArrayqualityMetrics.那ArrayTools.那Atacseqqc.那吸引那舞会礼服那Batchqc.那Beadarray那beadarrayusecases.那生物墨呢那BIRTE.那bsseq那Bubbletree.那Bumphunter.那索布尔那癌变分析那癌症那卡斯珀那催化剂那冠军那魅力那浮雕那Chippeakanno.那丁浓缩那coexnet.那Compcoder.那承认那达人古怪那CountClust那CRLMM.那Crossmeta.那CSAW.那CTSGE.那cytofWorkflow那Damireseq.那达巴马尔那德布雷斯勒那部那derfinderplot那去掉那困惑那diffcyt.那diffHic那差异那DmelSGI那dmrcate.那Doscheda.那德里姆瑟克那EBSEA.那EEGC.那埃拉德那EGSEA那enrichmentbrowser.那erccdashboard.那eventPointer.那探索酶那ExpressionNormalizationWorkflow.那流动那Gcrisprtools.那gdcrnatools.那GeneSelectMMD那GeneSelector那地理曲线那GGBase.那Gosummaries.那gqtlstats.那GUIDESEQ.那Hipathia.那htqpcr.那icheck.那ichip.那Icobra.那理想的那inpas.那isomiRs那limmaGUI那Linnorm.那lmdme.那lvsmirna那mapkl.那McSea.那餐那Methylkit.那甲基混合物那Methyvim.那米格莎那Minfi.那米尔拉布那MissMethyl.那MLSEQ.那mmpalatemirna.那单片那MoonlightR那MSstats那MultiDataSet那Nadfinder.那NEM.那罚款那nondetects.那OGSA.那奥林那omicrexposome.那PAA.那牧伙伴那PathoStat那PBCMC那pcaexplorer.那佩奇那百事可乐那幻想那phenoTest那聚酯纤维那psichomics.那QSEA.那rcgh.那revountworkflow.那regsplice.那ReportingTools.那林诺那rnainteract.那rnaity那rtcgatoolbox.那rtn.那rtopper那嘘那烤那斯那Sepira.那seqsetvis那秒杀那simbindprofiles.那singlecelltk.那snapcgh.那STATegRa那SVA.那svaplsseq.那Systempiper.那tcgabiolinks.那timecourse那TPP.那转录图表那TVTB.那TweedeSeQ.那VSN.那山姆斯那纱
建议我	abarray.那AdacGH2.那阵列那beadarraySNP那生物室那BiocCaseStudies那二乙衫那Bloodcancermultiomics2017那类别那CompoundationCompare.那classifyr.那CMA.那COGPS.那Cydar.那德内捷德那descan2.那染料纤维那弯头那FGSEA.那吐那GeneSelector那geuvadistranscriptexpr.那Glimma那GSRI.那GSVA.那哈曼那散热那等待者那ivygapSE那l那lumi.那mammaprintdata.那桅杆那MDGSA.那methylumi那MLP.那NPGSEA.那oligo.那逆口那paxtoolsr.那PGSEA那钢琴那PLW.那预先那彪马那rcade.那rtopper那rtracklayer那七百年人那经验丰富的人那潜艇那摘要博马克那tximport.那ZFPKM.
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