该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅Kimod。
生物导体版本:3.7
该软件包允许使用混合的OMICS数据(转录组学,蛋白质组学,微阵列-CHIPS,RNA-SEQ数据),引入以下改进:每个表的距离选项(用于数字和/或分类变量),Bootstrap Resprap Respampling Techniques On On on Bootstrap所有方法的残差矩阵,可以使个人,变量和双状态方法的投影执行置信椭圆,以对妥协的投影变量(基因表达)进行投影。由于包装的主要目的是将这些技术用于OMIC数据分析,因此它包括来自四个不同的微阵列平台的示例数据(即Agilent,Affymetrix HGU 95,Affymetrix HGU 133和Affymetrix HGU 133PLUS 2.0)Cell Lines.NCI60_4Arrays是一个包含NCI-60微阵列数据的列表,在每个平台中仅随机选择了几百个基因,以保持包装的大小较小。数据与用于实施共递行分析的软件包相同。包装中的引用遵循APA-6量规范的样式。
作者:Maria Laura Zingaretti,Johanna Altair Demey-Zambrano,Jose Luis Vicente-Villardon,Jhonny Rafael Demey
维护者:m l zingaretti
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Browsevignettes(“ Kimod”)
R脚本 | Kimod A K表方法将多个Omics-Data整合在R中 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 实验数据,,,,基因表达,,,,微阵列,,,,蛋白质组学,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.8.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.3(R-3.3)(2。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | R(> = 3.3),方法 |
进口 | 簇,图形,生物酶 |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | kimod_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | kimod_1.8.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | kimod_1.8.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/kimod |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/kimod |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/kimod/ |
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