Kimod

doi:10.18129/b9.bioc.kimod

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅Kimod

K-桌子的方法来整合多个OMICS-DATA

生物导体版本:3.7

该软件包允许使用混合的OMICS数据(转录组学,蛋白质组学,微阵列-CHIPS,RNA-SEQ数据),引入以下改进:每个表的距离选项(用于数字和/或分类变量),Bootstrap Resprap Respampling Techniques On On on Bootstrap所有方法的残差矩阵,可以使个人,变量和双状态方法的投影执行置信椭圆,以对妥协的投影变量(基因表达)进行投影。由于包装的主要目的是将这些技术用于OMIC数据分析,因此它包括来自四个不同的微阵列平台的示例数据(即Agilent,Affymetrix HGU 95,Affymetrix HGU 133和Affymetrix HGU 133PLUS 2.0)Cell Lines.NCI60_4Arrays是一个包含NCI-60微阵列数据的列表,在每个平台中仅随机选择了几百个基因,以保持包装的大小较小。数据与用于实施共递行分析的软件包相同。包装中的引用遵循APA-6量规范的样式。

作者:Maria Laura Zingaretti,Johanna Altair Demey-Zambrano,Jose Luis Vicente-Villardon,Jhonny Rafael Demey

维护者:m l zingaretti

引用(从r内,输入引用(“ kimod”)):

安装

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文档

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PDF R脚本 Kimod A K表方法将多个Omics-Data整合在R中
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 实验数据,,,,基因表达,,,,微阵列,,,,蛋白质组学,,,,软件,,,,可视化
版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(2。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 3.3),方法
进口 ,图形,生物酶
链接
建议
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包装档案

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源包 kimod_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 kimod_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) kimod_1.8.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/kimod
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/kimod
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/kimod/
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