karyoploteR

这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅karyoploteR。

情节可定制的线性基因组显示任意数据

Bioconductor版本:3.7

karyoploteR创建核型块任意基因组和提供了一套完整的函数绘制任意数据。它模仿许多R基本图形函数耦合用坐标变化函数自动染色体和数据坐标映射到绘制坐标。除了提供的数据绘制功能,很容易添加新的。

作者:Bernat凝胶< bgel在igtp.cat >

维护人员:Bernat凝胶< bgel在igtp.cat >

从内部引用(R,回车引用(“karyoploteR”)):

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“karyoploteR”)

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browseVignettes (“karyoploteR”)

HTML	R脚本	karyoploteR装饰图案
PDF		参考手册

biocViews	ChIPSeq,CopyNumberVariation,报道,DNASeq,DataImport,MethylSeq,OneChannel,测序,软件,可视化
版本	1.6.3
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.4),地区,GenomicRanges、方法
进口	地区,GenomicRanges,