isomiRs

DOI:10.18129 / B9.bioc.isomiRs

此包适用于Bioconductor的3.7版;有关稳定的、最新的发布版本，请参见isomiRs。

分析小rna序列中的同质异构体和mirna

Bioconductor版本:3.7

mirna和同质异构体的特性，聚类和差异表达。

作者:Lorena Pantano [aut, cre]， Georgia Escaramis [aut]

维护者:洛伦娜·潘塔诺<洛伦娜。淡水沼泽gmail.com >

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“isomiRs”)

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超文本标记语言	R脚本	miRNA和同质ir分析
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	聚类,DifferentialExpression,RNASeq,软件,microrna的
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (R-3.3)(2.5年)
许可证	MIT +文件许可
取决于	R (> = 3.4),DiscriMiner,SummarizedExperiment
进口	AnnotationDbi,assertive.sets,BiocGenerics(> = 0.7.5),Biobase,DESeq2,IRanges,dplyr,GenomicRanges,gplots,ggplot2,gtools,gridExtra， grid, grDevices, graphics，GGally,limma、方法、RColorBrewer,readr,重塑,rlang统计数据,tidyr,S4Vectors,tidyr,宠物猫,targetscan.Hs.eg.db
链接
建议	knitr,org.Mm.eg.db,集群,clusterProfiler,pheatmap,BiocStyle,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	isomiRs_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	isomiRs_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	isomiRs_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/isomiRs
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ isomiRs
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/isomiRs/
包下载报告	下载数据