isobar

doi:10.18129/b9.bioc.isobar

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅isobar

分析和定量标记的MSMS蛋白质组学数据

生物导体版本:3.7

ISOBAR提供了用于分析具有同类标签(例如ITRAQ和TMT)标记的定量质谱蛋白质组学数据的预处理,归一化和报告生成的方法。功能用于集成和验证PTM中心数据集(ISOBAR-PTM)的模块。有关http://www.ms-isobar.org的更多信息。

作者:florian p breitwieser 和jacques colinge ,并在alexey stukalov 的贡献中.ch>和florent gluck

维护者:florian p breitwieser

引用(从r内,输入引用(“ isobar”)):

安装

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PDF R脚本 开发人员的iSobarbob电竞体育官网
PDF R脚本 用于量化PTM数据集的ISOBAR
PDF R脚本 ITRAQ和TMT蛋白定量的ISOBAR包装
PDF R脚本 Isobar软件包的用途
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 生物信息学,,,,质谱,,,,多蛋白酶,,,,蛋白质组学,,,,QualityControl,,,,软件
版本 1.26.0
在生物导体中 Bioc 2.9(R-2.14)(7年)
执照 LGPL-2
要看 r(> = 2.10.0),生物酶,统计,方法
进口 干扰,,,,plyr,,,,Biomart,,,,GGPLOT2
链接
建议 MSNBase,,,,orgmassspecr,,,,XML,,,,rjsonio,,,,HMISC,,,,GPLOTS,,,,rcolorbrewer,,,,栅格,,,,林玛,,,,引导,,,,DBI,,,,大量的
系统要求
增强
URL https://github.com/fbreitwieser/isobar
BugReports https://github.com/fbreitwieser/isobar/issues
取决于我
进口我
建议我 rforpoteomics
链接到我
构建报告

包装档案

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源包 isobar_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 isobar_1.26.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) isobar_1.26.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/isobar
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/isobar
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/isobar/
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