igvR

DOI:10.18129 / B9.bioc.igvR

这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅igvR。

igvR:整合基因组学查看器

Bioconductor版本:3.7

对进口的访问。js,整合基因组学查看器中运行一个web浏览器。

作者:保罗·香农

维修工:保罗·香农< paul.thurmond。香农在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“igvR”)

文档

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browseVignettes (“igvR”)

HTML	R脚本	igvR:编程访问进口。js,基于浏览器的基因组跟踪查看器
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	软件,ThirdPartyClient,可视化
版本	1.0.1
许可证	麻省理工学院+文件许可
取决于	R (> = 3.5.0),GenomicRanges,VariantAnnotation,rtracklayer,BrowserViz(> = 2.0)
进口	方法,BiocGenerics,httpuv,跑龙套
链接
建议	RUnit,BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	igvR_1.0.1.tar.gz
Windows二进制	igvR_1.0.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	igvR_1.0.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/igvR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ igvR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/igvR/
包下载报告	下载数据