iSEE

DOI:10.18129 / B9.bioc.iSEE

这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅iSEE。

交互式SummarizedExperiment探险家

Bioconductor版本:3.7

提供函数来创建一个交互式Shiny-based探索数据存储在SummarizedExperiment对象的图形用户界面,包括行和列级元数据。特别注意了单细胞SingleCellExperiment对象中的数据降维的可视化结果。

作者:夏洛特Soneson (aut (cre),亚伦Lun (aut),费德里科•马里尼(aut),凯文Rue-Albrecht (aut)

维护人员:费德里科•马里尼< marinif在uni-mainz.de >

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HTML	R脚本	iSEE用户指南
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文本		许可证

细节

biocViews	CellBasedAssays,聚类,DimensionReduction,FeatureExtraction,GUI,GeneExpression,SingleCell,软件,转录,转录组,可视化
版本	1.0.1
许可证	麻省理工学院+文件许可
取决于	R (> = 3.5),SummarizedExperiment,SingleCellExperiment
进口	方法,BiocGenerics,S4Vectors,跑龙套,统计数据,闪亮的,shinydashboard,shinyAce,shinyjs,DT,rintrojs,ggplot2,colourpicker,igraph,vipor,mgcv,reshape2,rentrez,AnnotationDbi、图形、grDevicesviridisLite,cowplot,尺度,dplyr
链接
建议	testthat,BiocStyle,knitr,rmarkdown,scRNAseq,嘘,Rtsne,irlba,RColorBrewer,冬青,org.Mm.eg.db,htmltools
SystemRequirements
增强了	ExperimentHub
URL	https://github.com/csoneson/iSEE
BugReports	https://github.com/csoneson/iSEE/issues
取决于我
进口我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	iSEE_1.0.1.tar.gz
Windows二进制	iSEE_1.0.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	iSEE_1.0.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/iSEE
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ iSEE
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/iSEE/
包下载报告	下载数据