hopach

DOI:10.18129 / B9.bioc.hopach

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见hopach．

分层有序分区和折叠混合(HOPACH)

Bioconductor版本:3.7

HOPACH聚类算法通过递归地划分数据集来构建一个簇的层次树，同时在每个级别上对簇进行排序和可能的折叠。该算法使用均值/中值分割轮廓(MSS)准则来识别具有最大同质聚类的树的级别。它还向下运行树以生成元素的最终有序列表。非参数引导允许人们估计每个元素属于每个聚类(模糊聚类)的概率。

作者:Katherine S. Pollard, Mark J. van der Laan < Laan at stat.berkeley.edu>和Greg Wall

维护者:Katherine S. Pollard < Katherine。Pollard在gladstone.ucsf.edu>

安装

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文档

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PDF	R脚本	hopach
PDF		参考手册

细节

biocViews	聚类，软件
版本	2.40.0
在Bioconductor	BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 13.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 2.11.0)，集群，Biobase、方法
进口	图形，grDevices，统计，utils，BiocGenerics
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.stat.berkeley.edu/~laan/http://docpollard.org/
全靠我
进口我	phenoTest
建议我	BiocCaseStudies
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	hopach_2.40.0.tar.gz
Windows二进制	hopach_2.40.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	hopach_2.40.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hopach
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/hopach
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/hopach/
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