该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅Hireadsprocessor。
生物导体版本:3.7
HireadsProcessor包含一组功能,使用户可以处理使用任何平台测序的LM-PCR产品。给定一个包含用于反复分解和样品元数据的参数的Excel/TXT文件,该功能自动化适配器的修剪和基因组产物的识别。进一步处理QC和丰度定量的基因组产物。
作者:nirav v malani
维护者:nirav v malani
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html | R脚本 | 使用HireadsProcessor |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 预处理,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.16.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.0(R-3.1)(4年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | 生物弦,,,,基因组签名,,,,生物比较,,,,Hiannotator,r(> = 3.0) |
进口 | Soniclength,,,,dplyr,,,,生物基因,,,,基因组机,,,,rsffreader,,,,readxl, 方法 |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,测试 |
系统要求 | blat,UCSC HG18以2位格式用于布拉特 |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
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源包 | hireadsprocessor_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | hireadsprocessor_1.16.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hireadsprocessor |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/hireadsprocessor |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/hireadsprocessor/ |
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