Hireadsprocessor

doi:10.18129/b9.bioc.hireadsprocessor

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅Hireadsprocessor

处理LM-PCR读取的功能454/Illumina数据

生物导体版本:3.7

HireadsProcessor包含一组功能,使用户可以处理使用任何平台测序的LM-PCR产品。给定一个包含用于反复分解和样品元数据的参数的Excel/TXT文件,该功能自动化适配器的修剪和基因组产物的识别。进一步处理QC和丰度定量的基因组产物。

作者:nirav v malani

维护者:nirav v malani

引用(从r内,输入引用(“ Hireadsprocessor”)):

安装

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html R脚本 使用HireadsProcessor
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 预处理,,,,测序,,,,软件
版本 1.16.0
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(4年)
执照 GPL-3
要看 生物弦,,,,基因组签名,,,,生物比较,,,,Hiannotator,r(> = 3.0)
进口 Soniclength,,,,dplyr,,,,生物基因,,,,基因组机,,,,rsffreader,,,,readxl, 方法
链接
建议 尼特,,,,测试
系统要求 blat,UCSC HG18以2位格式用于布拉特
增强
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包装档案

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源包 hireadsprocessor_1.16.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(El Capitan) hireadsprocessor_1.16.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hireadsprocessor
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/hireadsprocessor
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/hireadsprocessor/
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