Gwascat

DOI：10.18129 / b9.bioc.gwascat

此套餐适用于Biocumonds 3.7版;对于稳定的最新版本版本，请参阅Gwascat。

在embl-ebi gwas目录中表示和建模数据

生物导体版本：3.7

在embl-ebi gwas目录中表示和模型数据。

作者：vj carey

维护者：vj carey

安装

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文件

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PDF.	r script.	Gwascat - 探索Nhgri Gwas目录
HTML.	r script.	Gwascat：使用实验因素本体探索GWAS结果
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	遗传学那软件
版本	2.12.0
在生物导体中以来	BIOC 2.10（R-2.15）（6.5岁）
执照	艺术-2.0
依靠	r（> = 3.5.0），homo.sapiens.
进口	方法，生物根系那S4Vectors.（> = 0.9.25），绞喉那Genomeinfodb.那Genomicranges.（> = 1.29.6），Snpstats.那生物仪器那RSAMTOOLS.那rtracklayer.那gqtlstats.那GVIZ.那VariantAnnotation.那annotationhub.那annotationdbi.那基因组法那图形那GGBIO.那ggplot2.那概括分析
链接到
建议	do.db.那DT.，实用，kn那RBGL.那运行
系统要求
加强	snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37.
URL.
取决于我	升降机那vtpnet.
进口我
建议我	基因组织那gqtlbase.那gqtlstats.那Grasp2DB.那HMDBQuery.
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	gwascat_2.12.0.tar.gz.
Windows二进制文件	gwascat_2.12.0.zip.
Mac OS x 10.11（El Capitan）	gwascat_2.12.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/gwascat
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocumon.org：包装/ gwascat
包短网址	http://biocidodder.org/packages/gwascat/
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