石墨

DOI:10.18129 / B9.bioc.graphite

这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅石墨

从路径拓扑图形交互环境

Bioconductor版本:3.7

图形对象从路径拓扑来源于Biocarta, HumanCyc, KEGG, NCI,豹,Reactome和峰值数据库。

作者:< Gabriele Gabriele销售。销售unipd.it >,Enrica Calura , Chiara Romualdi

维护人员:Gabriele销售< Gabriele。销售unipd.it >

从内部引用(R,回车引用(石墨)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite(石墨)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(石墨)

PDF R脚本 从路径拓扑图形交互环境
HTML metabolites.html
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews BioCarta,GraphAndNetwork,KEGG,代谢组学,网络,通路,Reactome,软件,ThirdPartyClient
版本 1.26.3
Bioconductor自 BioC 2.9 (r - 2.14)(7年)
许可证 AGPL-3
取决于 R(> = 2.10),方法
进口 AnnotationDbi,使彻底失败,,httr,rappdirs统计,跑龙套
链接
建议 a4Preproc,所有,BiocStyle,限幅器,codetools,hgu133plus2.db,hgu95av2.db,嫁祸于,knitr,org.Hs.eg.db平行,R.rsp,RCy3,rmarkdown,SPIA(> = 2.2),testthat,topologyGSA(> = 1.4.0)
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 ToPASeq
进口我 EnrichmentBrowser,facopy,mogsa,ReactomePA
建议我 限幅器,
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 graphite_1.26.3.tar.gz
Windows二进制 graphite_1.26.3.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) graphite_1.26.3.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/graphite
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/石墨
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/graphite/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网