genomeIntervals

DOI:10.18129 / B9.bioc.genomeIntervals

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见genomeIntervals．

基因组区间操作

Bioconductor版本:3.7

这个包定义了表示基因组间隔的类，并提供了处理这些间隔的函数和方法。注意:该包为'girafe'包提供了基本的基础设施，并由'girafe'包进行了增强。

作者:Julien Gagneur < Gagneur at genzentrum. lmmu .de>， Joern Toedling, Richard Bourgon, Nicolas Delhomme

维护者:Julien Gagneur < Gagneur at genzentrum.lmu.de>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“genomeinterval”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“genomeIntervals”)

PDF	R脚本	genomeinterval包概述。
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，遗传学，基础设施，软件
版本	1.36.0
在Bioconductor	BioC 2.4 (R-2.9)(9.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 2.15.0)，方法，时间间隔(> = 0.14.0),BiocGenerics(> = 0.15.2)
进口	GenomeInfoDb(> = 1.5.8),GenomicRanges(> = 1.21.16),IRanges(> = 2.3.14),S4Vectors(> = 0.7.10)
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	girafe
进口我	easyRNASeq
建议我	RnaSeqTutorial
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	genomeIntervals_1.36.0.tar.gz
Windows二进制	genomeIntervals_1.36.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	genomeIntervals_1.36.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genomeIntervals
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ genomeinterval
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/genomeIntervals/
软件包下载报告	下载数据