funtooNorm

DOI:10.18129 / B9.bioc.funtooNorm

这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅funtooNorm。

标准化程序英飞纳姆HumanMethylation450 BeadChip工具包

Bioconductor版本:3.7

提供了一个功能正常化Illumina公司英人类甲基化450 BeadChip (Illumina公司450 k),纠正组织和/或细胞类型。

作者:西莉亚Greenwood <西莉亚。格林伍德在麦吉尔。ca >,斯捷潘Grinek <斯捷潘。grinek ladydavis。ca >,马克西姆鲟鳇鱼<马克西姆。在mail.mcgill鲟鳇鱼。ca >,凯瑟琳·克莱因<凯萨琳。克莱恩在mail.mcgill.ca >

维修工:凯萨琳克莱因<凯萨琳。克莱恩在mail.mcgill.ca >

安装

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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“funtooNorm”)

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PDF	R脚本	正常化Illumina公司英人类甲基化450 k与funtooNorm多种细胞类型
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文本		新闻

细节

biocViews	DNAMethylation,归一化,预处理,软件
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.4)
进口	请,matrixStats,minfi、方法、IlluminaHumanMethylation450kmanifest,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19,GenomeInfoDbgrDevices图形,统计数据
链接
建议	prettydoc,minfiData,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	funtooNorm_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	funtooNorm_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	funtooNorm_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/funtooNorm
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ funtooNorm
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/funtooNorm/
包下载报告	下载数据