啪嗒啪嗒地响

DOI:10.18129 / B9.bioc.flipflop

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见啪嗒啪嗒地响．

基于套索的异构体快速预测作为流动问题

Bioconductor版本:3.7

Flipflop根据RNA-Seq读取数据，发现在给定样本中表达的基因亚型及其丰度。它接受SAM格式的对齐文件作为输入。它还可以同时发现来自多个样本的转录本，增加统计能力。

作者:Elsa Bernard, Laurent Jacob, Julien Mairal, Jean-Philippe Vert

维护者:Elsa Bernard < Elsa。Bernard在mines-paristech.fr>

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“flipflop”)

文档

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browseVignettes(“触发器”)

PDF	R脚本	FlipFlop:基于套索的快速异型预测流问题
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing，RNASeq，RNASeqData，回归，软件
版本	1.18.0
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 2.10.0)
进口	方法,矩阵，IRanges，GenomicRanges、并行
链接
建议	GenomicFeatures
SystemRequirements	GNU使
增强了
URL	http://cbio.ensmp.fr/flipflop
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	flipflop_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	flipflop_1.18.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	flipflop_1.18.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flipflop
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/flipflop
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/flipflop/
软件包下载报告	下载数据