FGSEA.

DOI：10.18129 / b9.bioc.fgsea

此套餐适用于Biocumonds 3.7版;对于稳定的最新版本版本，请参阅FGSEA.。

快速基因设定富集分析

生物导体版本：3.7

包装实现了快速基因设定富集分析的算法。使用快速算法允许制作更多的排列并获得更精细的P值，这允许使用准确的Stantard方法来多个假设校正。

作者：Alexey Sergushichev [AUT，CRE]

维护者：Alexey Sergushichev

安装

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HTML.	r script.	使用FGSEA包
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细节

Biocviews.	不同的亚兴那基因表达那GenesetenRichment.那途径那软件
版本	1.6.0
在生物导体中以来	BIOC 3.4（R-3.3）（2年）
执照	MIT +文件许可证
依靠	r（> = 3.3），rcpp.
进口	data.table.那生物相投，统计，ggplot2.（> = 2.2.0），格拉底， 网格，FastMatch.那矩阵，实用程序
链接到	rcpp.
建议	testthat.那kn那RAMAMAMDOW.那反弹.DB.那annotationdbi.， 平行，org.mm.eg.db.那林马那地理曲线
系统要求	C ++ 11.
加强
URL.	https://github.com/ctlab/fgsea/
Bugreports.	https://github.com/ctlab/fgsea/issues.
取决于我	GSean.那ppinfer.
进口我	cemitool.那剂量那McSea.那幻想那钢琴
建议我	MDP.那PI.
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	FGSEA_1.6.0.tar.gz.
Windows二进制文件	fgsea_1.6.0.zip.（32-＆64位）
Mac OS x 10.11（El Capitan）	FGSEA_1.6.0.TGZ.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/fgsea.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包装/ FGSEA
包短网址	http://biocidodder.org/packages/fgsea/
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