fabia。

DOI:10.18129 / B9.bioc.fabia

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见fabia。

FABIA:双簇采集的因子分析

Bioconductor版本:3.7

“双簇获取因子分析”(FABIA)中的双簇。FABIA是一种基于模型的双集群技术,即同时对行和列进行集群。通过因子分析,在因子和加载矩阵都是稀疏的情况下,发现了双簇。FABIA是一个乘法模型,提取样本和特征模式之间的线性依赖关系。它捕获在基因表达测量中观察到的具有重尾的现实非高斯数据分布。FABIA利用了众所周知的模型选择技术,如EM算法和变分方法,并嵌入到贝叶斯框架中。FABIA根据它们的信息含量对团簇进行排名,并将假团簇与真团簇分开。代码是用C语言编写的。

作者:Sepp Hochreiter

维护者:Sepp Hochreiter

引文(从R内,输入引用(“fabia。”)):

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文本 新闻

细节

biocViews 聚类DifferentialExpression微阵列MultipleComparison软件StatisticalMethod可视化
版本 2.26.0
在Bioconductor BioC 2.7 (R-2.12)(8年)
许可证 LGPL (>= 2.1)
取决于 R (>= 2.8.0),Biobase
进口 方法,图形,grDevices,统计,utils
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL http://www.bioinf.jku.at/software/fabia/fabia.html
全靠我 hapFabia
进口我
建议我 fabiaData
链接到我
构建报告

包档案

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源包 fabia_2.26.0.tar.gz
Windows二进制 fabia_2.26.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) fabia_2.26.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fabia
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/fabia
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/fabia/
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