esetVis

DOI:10.18129 / B9.bioc.esetVis

此包适用于Bioconductor的3.7版;有关稳定的、最新的发布版本,请参见esetVis

expressionSet Bioconductor对象的可视化

Bioconductor版本:3.7

生物导体对象可视化的实用函数,包括光谱图,tsne和线性判别分析。可以通过ggplot2包进行静态绘图,也可以通过ggvis或rbokeh包进行交互。

作者:Laure Cougnaud < Laure。在openanalytics.eu cougnaud >

维护者:Laure Cougnaud < Laure。在openanalytics.eu cougnaud >

引文(从R中输入引用(“esetVis”)):

安装

要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“esetVis”)

文档

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browseVignettes(“esetVis”)

超文本标记语言 R脚本 esetVis包
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataRepresentation,DimensionReduction,通路,PrincipalComponent,软件,可视化
版本 1.6.3
Bioconductor自 BioC 3.4 (R-3.3)(2年)
许可证 GPL-3
取决于
进口 mpm,hexbin,Rtsne,中长期规划、网格Biobase,质量, stats, utils, grDevices, methods
链接
建议 ggplot2,ggvis,rbokeh,ggrepel,knitr,rmarkdown,所有,hgu95av2.db,AnnotationDbi,老鸨,SummarizedExperiment
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包 esetVis_1.6.3.tar.gz
Windows二进制 esetVis_1.6.3.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) esetVis_1.6.3.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/esetVis
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ esetVis
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/esetVis/
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