epivizr

doi:10.18129/b9.bioc.epivizr

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅epivizr

R接口到Epiviz Web应用程序

生物导体版本:3.7

该软件包提供了与Epiviz Web应用程序(http://epiviz.cbcb.umd.edu)的连接,用于基因组数据的交互式可视化。R/Bioc交互式会话中的对象可以显示在基因组浏览器轨道或图中,可以通过基因组区域进行导航探索。支持基本的生物导体数据结构(例如,基因组和远程符号特性对象),同时提供了一种简单的机制来支持其他数据结构(通过包装epivizrdata)。可视化(使用d3.js)也可以轻松地添加到Web应用程序中。

作者:Hector Corrada Bravo,Florin Chelaru,Llewellyn Smith,Naomi Goldstein,Jayaram Kancherla,Morgan Walter,Brian Gottfried

维护者:hector Corrada bravo

引用(从r内,输入引用(“ epivizr”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ epivizr”)

文档

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browsevignettes(“ epivizr”)

html R脚本 Epivizr简介
PDF 参考手册
文本 消息
视频 eviviz快速旅行

细节

生物浏览 GUI,,,,基础设施,,,,软件,,,,可视化
版本 2.10.0
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(5年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 3.0),方法
进口 Epivizrserver(> = 1.1.1),epivizrdata(> = 1.3.4),基因组机,,,,S4VECTORS,,,,iranges
链接
建议 测试,,,,roxygen2,,,,尼特,,,,生物酶,,,,总结性特征,,,,抗fofilesdata,,,,hgu133plus2.db,,,,mus.musculus,,,,生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我 EPIVIZRSTANTALLONE
进口我 metavizr
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 epivizr_2.10.0.tar.gz
Windows二进制 epivizr_2.10.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) epivizr_2.10.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epivizr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/epivizr
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/epivizr/
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