eisa

DOI:10.18129 / B9.bioc.eisa

此包适用于Bioconductor的3.7版;有关稳定的、最新的发布版本，请参见eisa。

通过迭代签名算法进行表达式数据分析

Bioconductor版本:3.7

迭代签名算法(ISA)是一种双聚类算法;它在基因表达(或其他表格)数据中发现相关的块(转录模块)。ISA能够发现重叠的模块，并且对噪声有弹性。这个包提供了ISA的方便接口，使用标准的BioConductor数据结构;还包含各种可视化工具，可以与其他双聚类算法一起使用。

作者:Gabor Csardi < Csardi。伽柏gmail.com >

维护者:Gabor Csardi < Csardi。伽柏gmail.com >

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“eisa”)

文档

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browseVignettes (eisa)

PDF	R脚本	基因表达数据的迭代签名算法
PDF		参考手册

细节

biocViews	分类,GeneExpression,微阵列,软件,可视化
版本	1.32.0
Bioconductor自	BioC 2.6 (R-2.11)(8.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	isa2,Biobase(> = 2.17.8),AnnotationDbi、方法
进口	BiocGenerics,类别,genefilter,DBI
链接
建议	igraph(> = 0.6),矩阵,GOstats,GO.db,KEGG.db,biclust,质量,xtable,所有,hgu95av2.db,targetscan.Hs.eg.db,org.Hs.eg.db
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	ExpressionView
进口我	ExpressionView
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	eisa_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	eisa_1.32.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	eisa_1.32.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/eisa
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ eisa
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/eisa/
包下载报告	下载数据