边缘
DOI:10.18129 / B9.bioc.edge
此包适用于Bioconductor的3.7版;有关稳定的、最新的发布版本，请参见边缘。
差异基因表达的提取
Bioconductor版本:3.7
边缘包实现了进行全基因组基因表达研究的差异表达分析的方法。对一般研究设计采用最优发现程序和广义似然比检验(相当于f检验和t检验)进行显著性检验。特殊的功能可以方便地分析常见的研究设计，包括时间过程实验。edge还集成了snm、sva和qvalue等其他软件包，为基因表达分析提供了广泛的工具。
作者:John D. Storey, Jeffrey T. Leek和Andrew J. Bass
维护:John D. Storey
引文(从R中输入引用(“边缘”)):
安装
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##如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“边缘”)
文档
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browseVignettes(“边缘”)
| R脚本 | 包边 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | DataImport,DifferentialExpression,GeneExpression,MultipleComparison,回归,软件,TimeCourse |
| 版本 | 2.12.2 |
| Bioconductor自 | BioC 3.1 (R-3.2)(3.5年) |
| 许可证 | MIT +文件许可 |
| 取决于 | R (> = 3.1.0),Biobase |
| 进口 | 方法、样条函数股东价值分析,球形结构,稻草人,qvalue(> = 1.99.0),质量 |
| 链接 | |
| 建议 | testthat,knitr,ggplot2,reshape2 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/jdstorey/edge |
| BugReports | https://github.com/jdstorey/edge/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | edge_2.12.2.tar.gz |
| Windows二进制 | edge_2.12.2.zip(32位和64位) |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | edge_2.12.2.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/edge |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/边缘 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/edge/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
