diffcyt

DOI:10.18129 / B9.bioc.diffcyt

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见diffcyt．

通过高分辨率聚类的高维细胞仪鉴别发现

Bioconductor版本:3.7

高维细胞术数据(包括流式细胞术、大规模细胞术或CyTOF和寡核苷酸标记细胞术)中差异发现分析的统计方法，基于(i)高分辨率聚类和(ii)改编自转录组学的经验贝叶斯调节试验。

作者:卢卡斯·m·韦伯[aut, cre]

维护者:Lukas M. Weber

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“diffcyt”)

文档

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超文本标记语言	R脚本	diffcyt工作流
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	CellBasedAssays，CellBiology，聚类，FeatureExtraction，FlowCytometry，蛋白质组学，SingleCell，软件
版本	1.0.10
许可证	MIT +文件许可
取决于	R (>= 3.5.0)
进口	flowCore，FlowSOM，SummarizedExperiment，S4Vectors，limma，刨边机，lme4，multcomp，dplyr，tidyr，reshape2，magrittr，统计，方法，utils, grDevices，图形，ComplexHeatmap，circlize、网格
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，HDCytoData，催化剂
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/lmweber/diffcyt
BugReports	https://github.com/lmweber/diffcyt/issues
全靠我
进口我
建议我	催化剂
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	diffcyt_1.0.10.tar.gz
Windows二进制	diffcyt_1.0.10.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	diffcyt_1.0.10.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/diffcyt
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/diffcyt
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/diffcyt/
软件包下载报告	下载数据