此套餐适用于Biocumonds 3.7版;对于稳定的最新版本版本,请参阅DDCT.。
生物导体版本:3.7
Delta-Delta-CT(DDCT)算法是用定量实时PCR(QRT-PCR)实验确定相对基因表达的近似方法。与其他方法相比,它不需要每个引物 - 目标对的标准曲线,因此减少了工作负荷,并且只要放大效率保持的假设,就可以获得足够的准确结果。DDCT包实现了一个管道以收集,分析和可视化QRT-PCR结果,例如来自Taqman SDM软件的QRT-PCR结果,主要使用DDCT方法。管道可以由命令行中的脚本或通过由S4类,方法和功能组成的API来调用。
作者:Jitao David张,Rudolf Biczok和Markus Ruschhaupt
维护者:jitao david zhang
引文(从R内,输入引文(“DDCT”)
):
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##尝试http://如果不支持https:// url源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)bioclite(“ddct”)
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BROWSEVIGNETTES(“DDCT”)
PDF. | r script. | 使用DDCT包中的端到端脚本分析RT-PCR数据 |
PDF. | r script. | 如何应用DDCT方法 |
PDF. | r script. | QRT-PCR数据分析DDCT方法简介:背景,算法和示例 |
PDF. | 参考手册 |
Biocviews. | 不同的亚兴那基因表达那microttreplateassay那软件那QPCR. |
版本 | 1.36.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 2.5(R-2.10)(9年) |
执照 | LGPL-3 |
依靠 | R(> = 2.3.0),方法 |
进口 | BioBase.(> = 1.10.0),rcolorbrewer.(> = 0.1-3),xtable.那格子那生物根系 |
链接到 | |
建议 | 运行 |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
源包 | ddct_1.36.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | ddct_1.36.0.zip. |
Mac OS x 10.11(El Capitan) | ddct_1.36.0.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/ddct. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondion.org:包/ DDCT |
包短网址 | http://biocidodder.org/packages/ddct/ |
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