DDCT.

DOI:10.18129 / b9.bioc.ddct.

此套餐适用于Biocumonds 3.7版;对于稳定的最新版本版本,请参阅DDCT.

定量实时PCR分析的DDCT算法(QRT-PCR)

生物导体版本:3.7

Delta-Delta-CT(DDCT)算法是用定量实时PCR(QRT-PCR)实验确定相对基因表达的近似方法。与其他方法相比,它不需要每个引物 - 目标对的标准曲线,因此减少了工作负荷,并且只要放大效率保持的假设,就可以获得足够的准确结果。DDCT包实现了一个管道以收集,分析和可视化QRT-PCR结果,例如来自Taqman SDM软件的QRT-PCR结果,主要使用DDCT方法。管道可以由命令行中的脚本或通过由S4类,方法和功能组成的API来调用。

作者:Jitao David张,Rudolf Biczok和Markus Ruschhaupt

维护者:jitao david zhang

引文(从R内,输入引文(“DDCT”)):

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##尝试http://如果不支持https:// url源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)bioclite(“ddct”)

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PDF. r script. 使用DDCT包中的端到端脚本分析RT-PCR数据
PDF. r script. 如何应用DDCT方法
PDF. r script. QRT-PCR数据分析DDCT方法简介:背景,算法和示例
PDF. 参考手册

细节

Biocviews. 不同的亚兴基因表达microttreplateassay软件QPCR.
版本 1.36.0
在生物导体中以来 BIOC 2.5(R-2.10)(9年)
执照 LGPL-3
依靠 R(> = 2.3.0),方法
进口 BioBase.(> = 1.10.0),rcolorbrewer.(> = 0.1-3),xtable.格子生物根系
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源包 ddct_1.36.0.tar.gz.
Windows二进制文件 ddct_1.36.0.zip.
Mac OS x 10.11(El Capitan) ddct_1.36.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/ddct.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/ DDCT
包短网址 http://biocidodder.org/packages/ddct/
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