cytofkit

DOI:10.18129 / B9.bioc.cytofkit

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见cytofkit

Cytofkit:集成的海量细胞仪数据分析管道

Bioconductor版本:3.7

一个集成的大规模细胞术数据分析管道,能够同时说明细胞的多样性和进展。

作者:陈金淼,陈浩,Matthew Myint

维护者:Jinmiao Chen , Matthew Myint

引文(从R内,输入引用(“cytofkit”)):

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细节

biocViews BiomedicalInformaticsCellBiology聚类DimensionReductionFlowCytometryGUI软件
版本 1.12.0
在Bioconductor BioC 3.1 (R-3.2)(3.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.4.0),ggplot2plyr
进口 tcltk, grDevices,图形,utils,统计,Rtsnee1071flowCoregplotscolourpickerVGAMreshape2ggrepel闪亮的shinyFiles素食主义者BiobasedoParallel平行,pdist、方法、命运FlowSOM(> = 1.4.0),igraph(> = 1.1.2),RANN(> = 2.5),Rcpp(> = 0.12.0)
链接 Rcpp
建议 knitrRUnittestthatBiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/JinmiaoChenLab/cytofkit
BugReports https://github.com/JinmiaoChenLab/cytofkit/issues
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源包 cytofkit_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 cytofkit_1.12.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) cytofkit_1.12.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cytofkit
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cytofkit
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/cytofkit/
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