此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见cytofkit.
Bioconductor版本:3.7
一个集成的大规模细胞术数据分析管道,能够同时说明细胞的多样性和进展。
作者:陈金淼,陈浩,Matthew Myint
维护者:Jinmiao Chen
引文(从R内,输入引用(“cytofkit”)
):
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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“cytofkit”)
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browseVignettes(“cytofkit”)
超文本标记语言 | R脚本 | 分析管道 |
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超文本标记语言 | R脚本 | ShinyAPP教程 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | BiomedicalInformatics,CellBiology,聚类,DimensionReduction,FlowCytometry,GUI,软件 |
版本 | 1.12.0 |
在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(3.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.4.0),ggplot2,plyr |
进口 | tcltk, grDevices,图形,utils,统计,Rtsne,e1071,flowCore,gplots,colourpicker,VGAM,reshape2,ggrepel,闪亮的,shinyFiles,素食主义者,Biobase,doParallel平行,pdist、方法、命运,FlowSOM(> = 1.4.0),igraph(> = 1.1.2),RANN(> = 2.5),Rcpp(> = 0.12.0) |
链接 | Rcpp |
建议 | knitr,RUnit,testthat,BiocGenerics |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/JinmiaoChenLab/cytofkit |
BugReports | https://github.com/JinmiaoChenLab/cytofkit/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | cytofkit_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | cytofkit_1.12.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | cytofkit_1.12.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cytofkit |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cytofkit |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/cytofkit/ |
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