csaw

DOI:10.18129 / B9.bioc.csaw

这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅csaw。

与Windows ChIP-Seq分析

Bioconductor版本:3.7

检测不同绑定地区ChIP-seq数据与滑动窗口,归一化方法和适当的罗斯福控制。

作者:亚伦Lun wehi.edu.au > <阿伦,戈登史密斯<史密斯在wehi.edu.au >

维修工:亚伦Lun <阿伦在wehi.edu.au >

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文本		新闻

细节

biocViews	注释,ChIPSeq,报道,DifferentialPeakCalling,遗传学,MultipleComparison,归一化,测序,软件
版本	1.14.1
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(4年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.5),GenomicRanges,SummarizedExperiment,BiocParallel
进口	Rsamtools,刨边机,limma,GenomicFeatures,AnnotationDbi、方法、S4Vectors,IRanges,GenomeInfoDb,Rhtslib统计数据,Rcpp
链接	Rhtslib(> = 1.12.1),zlibbioc,Rcpp
建议	org.Mm.eg.db,TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL
取决于我	chipseqDB
进口我	diffHic,NADfinder,火神
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	csaw_1.14.1.tar.gz
Windows二进制	csaw_1.14.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	csaw_1.14.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/csaw
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ csaw
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/csaw/
包下载报告	下载数据