该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅共识。
生物导体版本:3.7
该软件包比较了基因组位置和基因组范围,从多个实验提取共同区域。分析区域的大小是可调的,以及必须在潜在区域中存在特征以将该区域标记为共识区域的经验数量。
作者:Astrid Deschenes [CRE,AUT],Fabien Claude Lamaze [CTB],Pascal Belleau [aut],Arnaud Droit [aut]
维护者:Astrid Deschenes
引用(从r内,输入引用(“共识”)
):
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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ https://www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ consensusseeker”)
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Browsevignettes(“共识”)
html | R脚本 | 检测一组实验内的共识区域 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 生物问题,,,,chipseq,,,,覆盖范围,,,,遗传学,,,,多重组合,,,,峰值探测,,,,测序,,,,软件,,,,转录 |
版本 | 1.8.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.3(R-3.3)(2。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 2.10),生物基因,,,,iranges,,,,基因组机,,,,生物比较 |
进口 | GenomeInfodB,,,,rtracklayer,,,,Stringr,,,,S4VECTORS, 方法 |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,GGPLOT2,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,运行 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/arnauddroitlab/consensusseeker |
BugReports | https://github.com/arnauddroitlab/consensusseeker/issues |
取决于我 | |
进口我 | RJMCMCN核小体 |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | CONSENSUSSEEKER_1.8.0.TAR.GZ |
Windows二进制 | 共识Seeker_1.8.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | CONSENSUSSEEKER_1.8.0.TGZ |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/consensusseeker |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/共识者 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/consensusseeker/ |
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