coexnet.

DOI：10.18129 / b9.bioc.coexnet.

此套餐适用于Biocumonds 3.7版;对于稳定的最新版本版本，请参阅coexnet.。

coexNet：一个r包，用于从微阵列数据构建共同表达网络

生物导体版本：3.7

从Geo DataSets（.cel文件）中提取基因表达式矩阵作为辅助禁止对象。此外，可以使用两种不同的方法（VSN和RMA）进行归一化过程。概述（从多探针转到一个基因）使用两种不同的标准（样本表达数据的最大值和中值），并且基因的过程使用两种方法（SAM和ACDE）进行差异表达分析。可以使用两种不同的方法，Pearson相关系数（PCC）或互信息（MI）来沟通共表达网络的结构，并使用图形理论方法选择阈值。

作者：Juan David Henao [Aut，Cre]，Liliana Lopez-Kleine [Aut]，Andres Pinzon-Velasco [Aut]

维护者：Juan David Henao

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PDF.	r script.	标题
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	不同的亚兴那基因表达那graphandnetwork.那微阵列那网络那网络投机那正常化那软件那系统生物学
版本	1.2.0
执照	LGPL.
依靠	r（> = 3.4）
进口	敬服那siggenes.那地理曲线那VSN.那iGraph.那ACDE.那BioBase.那林马，图形，统计数据，实用程序，stringdb.那概括分析那矿物质那RAMAMAMDOW.
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建议	运行那生物根系那kn
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包档案包

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源包	coexnet_1.2.0.tar.gz.
Windows二进制文件	coexnet_1.2.0.zip.
Mac OS x 10.11（El Capitan）	coexnet_1.2.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/coexnet.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ coexNet
包短网址	http://biocidodder.org/packages/coexnet/
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