该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅彗星。
生物导体版本:3.7
EWA的可视化导致基因组区域。除了表型缔合p值外,彗星还生成了共甲基化模式的图,并提供了一系列注释轨道。只要数据可以转化为基因组水平和任何物种,它就可以用于其他范围内的关联扫描。
作者:Tiphaine C. Martin [AUT,CRE],Thomas Hardiman [AUT],IDIL [AUT],PEI-CHIEN TSAI [AUT],JORDANA T. BELL [AUT]
维护者:MSSM.edu的Tiphaine Martin
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Browsevignettes(“彗星”)
R脚本 | 彗星用户指南 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | chipseq,,,,DNAMETHYLATY,,,,dnaseq,,,,差甲基化,,,,Exomeseq,,,,功能基因组学,,,,遗传学,,,,Genomewideassociation,,,,甲基,,,,甲基化array,,,,微阵列,,,,图案,,,,rnaseq,,,,核糖,,,,测序,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.12.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.1(R-3.2)(3.5岁) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 3.4.0),网格,utils,Biomart,,,,GVIZ,,,,心理 |
进口 | Colortools,,,,哈希,grdevices,栅格,,,,rtracklayer,,,,iranges,,,,S4VECTORS,,,,基因组机,统计Corrplot |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,运行,,,,生物基因 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://epigen.kcl.ac.uk/comet |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | comet_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | comet_1.12.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | comet_1.12.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/comet |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/彗星 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/comet/ |
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