cn.farms

DOI:10.18129 / B9.bioc.cn.farms

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见cn.farms．

cn。农场-因子分析拷贝数估计

Bioconductor版本:3.7

这个包实现了cn。拷贝数变异(CNV)分析的FARMS算法。cn。FARMS允许分析最常见的Affymetrix (250K-SNP6.0)阵列类型，支持使用snow和ff进行高性能计算。

作者:Andreas Mitterecker, Djork-Arne Clevert

维护者:Andreas Mitterecker < Mitterecker at bioinf.jku.at>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“cn.farms”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“cn.farms”)

PDF	R脚本	cn.farms: Manual for the R package
PDF		参考手册

细节

biocViews	CopyNumberVariation，微阵列，软件
版本	1.28.0
在Bioconductor	BioC 2.8 (R-2.13)(7.5年)
许可证	LGPL (>= 2.0)
取决于	R (>= 3.0)，Biobase、方法、ff，oligoClasses，雪
进口	DBI，affxparser，益生元，DNAcopy，preprocessCore，晶格
链接
建议	pd.mapping250k.sty，pd.mapping250k.nsp，pd.genomewidesnp.5，pd.genomewidesnp.6
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.bioinf.jku.at/software/cnfarms/cnfarms.html
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	cn.farms_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	cn.farms_1.28.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	cn.farms_1.28.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cn.farms
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cn.farms
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cn.farms/
软件包下载报告	下载数据