chipenrich

DOI:10.18129 / B9.bioc.chipenrich

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见chipenrich．

ChIP-seq峰值数据的基因集富集

Bioconductor版本:3.7

ChIP-Enrich使用来自ChIP-seq实验的峰进行基因集富集测试。该方法对基因长度、基因周围序列的可映射性等混杂因素进行了经验校正。

作者:Ryan P. Welch [aut, cph]， Chee Lee [aut]， Raymond G. Cavalcante [aut, cre]， Chris Lee [aut]， Laura J. Scott [ths]， Maureen A. Sartor [ths]

维护者:Raymond G. Cavalcante

安装

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文档

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超文本标记语言	R脚本	chipenrich_vignette
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq，表观遗传学，FunctionalGenomics，GeneSetEnrichment，HistoneModification，回归，软件
版本	测试盒框
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.4.0)
进口	AnnotationDbi，BiocGenerics，chipenrich.data，GenomeInfoDb，GenomicRanges， grDevices，网格，IRanges，晶格，latticeExtra、方法、mgcv，org.Dm.eg.db，org.Dr.eg.db，org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，org.Rn.eg.db平行,plyr，rms，rtracklayer，S4Vectors统计数据,stringr,跑龙套
链接
建议	BiocStyle，devtools，knitr，rmarkdown，roxygen2，testthat
SystemRequirements
增强了
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全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

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源包	chipenrich_2.4.0.tar.gz
Windows二进制	chipenrich_2.4.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	chipenrich_2.4.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chipenrich
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/chipenrich
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/chipenrich/
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