CellHTS2
doi：10.18129/b9.bioc.cellhts2
该包适用于生物导体的3.7版；对于稳定的最新版本，请参阅CellHTS2。
基于细胞的屏幕的分析 - CellHT的修订版
生物导体版本：3.7
该软件包提供了用于分析以微量定板格式执行的高通量测定法（包括但不限于384孔板）的工具。该功能包括数据导入和管理，归一化，质量评估，复制摘要和统计评分。提供了有关数据和分析结果的详细图形概述的网页。在我们的工作中，我们将包装应用于苍蝇和人类细胞的RNAi屏幕，以及酵母库的屏幕。简要介绍，请参阅“ CellHTS2”。
作者：Ligia Bras，Wolfgang Huber
维护者：约瑟夫·巴里（Joseph Barry）
引用（从r内，输入引用（“ CellHTS2”））：
安装
要安装此软件包，请启动R并输入：
##尝试http：//如果不支持https：// url不支持源（“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”）bioclite（“ cellhts2”）
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ CellHTS2”）
| R脚本 | 主要小插图（完整版本）：基于单元的屏幕的端到端分析 | |
| R脚本 | 主要小插图：基于细胞的屏幕的端到端分析 | |
| R脚本 | 补充：增强剂 - 抑制器屏幕 | |
| R脚本 | 补充：多通道测定 | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 蜂窝基，，，，预处理，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 2.44.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.1（R-2.6）（11年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 2.10），rcolorbrewer，，，，生物酶， 方法，GeneFilter，，，，斑点，，，，VSN，，，，HWRITER，，，，Locfit， 网格 |
| 进口 | 普拉达，，，，gseabase，，，，类别，stats4，生物基因 |
| 链接 | |
| 建议 | GGPLOT2 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | http://www.dkfz.de/signalinghttp://www.ebi.ac.uk/huber |
| 取决于我 | ImageHts，，，，Starank |
| 进口我 | gesper，，，，HTSANALYZER，，，，rnainteract |
| 建议我 | 生物萨尔，，，，普拉达 |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | cellhts2_2.44.0.tar.gz |
| Windows二进制 | cellhts2_2.44.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | cellhts2_2.44.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cellhts2 |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/cellhts2 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/cellhts2/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
