这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅categoryCompare。
Bioconductor版本:3.7
计算重要的注释(类别)的两个(或更多)特性(即基因)列表,决定注释之间的重叠,并返回图形和表格数据的重要的注释和功能列表的组合注释被发现是重要的。交互式探索通过使用RCytoscape(严重建议)。
作者:罗伯特·m·飞行< rflight79 gmail.com >
维修工:罗伯特·m·飞行< rflight79 gmail.com >
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HTML | R脚本 | categoryCompare:高通量数据分析使用基因注释 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 注释,去,GeneExpression,MultipleComparison,通路,软件 |
版本 | 1.24.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.10 (r - 2.15)(6.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (> = 2.10),Biobase,BiocGenerics(> = 0.13.8) |
进口 | AnnotationDbi,hwriter,GSEABase,类别(> = 2.33.1),GOstats,注释,色彩,图,RCy3(> = 1.99.29)方法、grDevices跑龙套 |
链接 | |
建议 | knitr,GO.db,KEGG.db,雌激素,org.Hs.eg.db,hgu95av2.db,limma,affy,genefilter |
SystemRequirements | Cytoscape(> = 3.6.1)(如果用于可视化的结果,严重建议) |
增强了 | |
URL | https://github.com/rmflight/categoryCompare |
BugReports | https://github.com/rmflight/categoryCompare/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | categoryCompare_1.24.0.tar.gz |
Windows二进制 | categoryCompare_1.24.0.zip |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | categoryCompare_1.24.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/categoryCompare |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ categoryCompare |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/categoryCompare/ |
包下载报告 | 下载数据 |