癌症

DOI:10.18129 / b9.bioc.cancer.

此套餐适用于Biocumonds 3.7版;对于稳定的最新版本版本,请参阅癌症

一种用于访问和建模MSKCC的癌症基因组学数据的图形用户界面。

生物导体版本:3.7

该包装是基于CGDSR和其他建模包的用户友好界面,用于探索,比较和分析由计算生物学托管的所有可用癌症数据(临床数据,基因突变,基因甲基化,基因表达,蛋白质磷酸化,拷贝数改变)在纪念 - 斯洛安 - 克隆癌症中心(MSKCC)的中心。

作者:Karim Mezhoud。核安全与安全部。突尼斯核科学中心。

维护者:Karim Mezhoud

引文(从R内,输入引文(“癌症”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“癌症”)

文件

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Browsevignettes(“癌症”)

PDF. 癌症小插图
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 吉伊基因表达软件
版本 1.14.0
在生物导体中以来 BIOC 3.1(R-3.2)(3.5岁)
执照 GPL-2
依靠 R(> = 3.3),TCLTK,TCLTK2CGDSR.
进口 GSEABASE.GSEALMTkrplot.Genetclassifier运行公式rpart.生存BioBase.现象盘旋普利尔,图形,统计数据,utils
链接到
建议 testthat.(> = 0.10.0),r.rsp.
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源包 cancer_1.14.0.tar.gz.
Windows二进制文件 cancer_1.14.0.zip.
Mac OS x 10.11(El Capitan) cancer_1.14.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/cancer.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondudard.org:包裹/癌症
包短网址 http://biocidodder.org/packages/cancer/
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