BSSEQ

doi:10.18129/b9.bioc.bsseq

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅BSSEQ

分析,管理和存储Bisulfite测序数据

生物导体版本:3.7

用于分析和可视化Bisulfite测序数据的工具集合。

作者:Kasper Daniel Hansen [AUT,CRE],Peter Hickey [aut]

维护者:gmail.com上的Kasper Daniel Hansen

引用(从r内,输入引用(“ BSSEQ”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ bsseq”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ BSSEQ”)

html R脚本 用BSSEQ分析WGB数据
html R脚本 BSSEQ用户指南
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 DNAMETHYLATY,,,,软件
版本 1.16.1
在生物导体中 Bioc 2.11(R-2.15)(6年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 3.3),方法,生物基因,,,,基因组机(> = 1.29.14),总结性特征(> = 1.9.18),并行
进口 iranges(> = 2.11.16),GenomeInfodB,,,,,统计,图形,生物酶,,,,Locfit,,,,gtools,,,,Data.Table,,,,S4VECTORS,,,,r.utils(> = 2.0.0),延迟的matrixstats(> = 1.1.12),输入,,,,林玛,,,,延迟(> = 0.5.34),HDF5Array
链接
建议 运行,,,,BSSEQDATA,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,尼特
系统要求
增强
URL https://github.com/kasperdanielhansen/bsseq
BugReports https://github.com/kasperdanielhansen/bsseq/issues
取决于我 BSSEQDATA,,,,DMRSEQ,,,,DSS
进口我 米拉,,,,Scmeth
建议我 组织
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 bsseq_1.16.1.tar.gz
Windows二进制 bsseq_1.16.1.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) bsseq_1.16.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bsseq
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/bsseq
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/bsseq/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网