分歧点

DOI:10.18129 / B9.bioc.branchpointer

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见分歧点

内含子剪接分支点的预测

Bioconductor版本:3.7

预测内含子分支点窗口中位点的分支点概率。查询可以作为内含子区域提供;或者评估突变的影响,snp。

作者:Beth Signal

维护者:Beth信号

引文(从R内,输入引用(“分歧点”)):

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“branchpointer”)

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PDF R脚本 使用分支指针注释内含子人剪接分支点
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文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews GenomeAnnotationGenomicVariationMotifAnnotation软件
版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 3.5 (R-3.4)(1.5年)
许可证 BSD_3_clause + file LICENSE
取决于 脱字符号, r (>= 3.4)
进口 plyrkernlab“绿带运动”stringrcowplotggplot2biomaRtBiostrings,并行,utils,统计,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38rtracklayerGenomicRangesGenomeInfoDbIRangesS4Vectorsdata.table
链接
建议 knitrBiocStyle
SystemRequirements
增强了
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源包 branchpointer_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 branchpointer_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) branchpointer_1.6.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/branchpointer
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/branchpointer
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/branchpointer/
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