biosigner

DOI:10.18129 / B9.bioc.biosigner

此包适用于Bioconductor的3.7版本;有关稳定的最新发布版本，请参见biosigner．

从组学数据中发现签名

Bioconductor版本:3.7

在组学数据分析中，特征选择是从复杂的高维数据中提取限制性和有意义的分子特征，构建鲁棒分类器的关键。这个包实现了一种新的方法，用于评估分类器预测性能的变量的相关性。该方法可以与PLS-DA、随机森林和支持向量机二进制分类器并行运行。返回签名和相应的“受限”模型，从而实现对新数据集的未来预测。该包的Galaxy实现可在Workflow4metabolomics.org计算代谢组学在线基础设施中获得。

作者:Philippe Rinaudo <博士。rinaudo在gmail.com>， Etienne thevennot < Etienne。他们不在cea.fr>

维护者:Philippe Rinaudo <博士。rinaudo在gmail.com>， Etienne thevennot < Etienne。他们不在cea.fr>

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("biosigner")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“biosigner”)

超文本标记语言	R脚本	装饰图案的标题
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	分类，FeatureExtraction，Lipidomics，代谢组学，蛋白质组学，软件，转录组
版本	1.8.0
在Bioconductor公司	BioC 3.3 (R-3.3)(2.5年)
许可证	CeCILL
取决于
进口	方法,e1071，randomForest，ropls，Biobase
链接
建议	BioMark，RUnit，BiocGenerics，BiocStyle，golubEsets，hu6800.db，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	biosigner_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	biosigner_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	biosigner_1.8.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biosigner
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/biosigner
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/biosigner/
软件包下载报告	下载数据