bigmemoryExtras

DOI:10.18129 / B9.bioc.bigmemoryExtras

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见bigmemoryExtras．

大内存包的扩展，增加了安全性、便利性和因子类

Bioconductor版本:3.7

这个包定义了一个"BigMatrix"引用类，它为bigmemory包中的filebacked.big.matrix类添加了安全和方便的特性。BigMatrix通过监视和优雅地恢复到磁盘上数据的连接来防止段错误，它还通过基于文件系统的权限系统防止意外的数据修改。我们提供了在Biobase包的eSet类家族中使用bigmatrix派生类作为assayData矩阵的实用程序。BigMatrix提供了一些与附加和索引带有dimnames的文件支持矩阵相关的优化。此外，该包还提供了一个“BigMatrixFactor”类，这是一个具有因子属性的文件支持矩阵。

作者:Peter M. Haverty

维护者:Peter M. Haverty < phverty at gene.com>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“bigmemoryExtras”)

文档

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文本		新闻

细节

biocViews	DataRepresentation，基础设施，软件
版本	1.28.0
在Bioconductor	BioC 2.11 (R-2.15)(6年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 2.12)，bigmemory(> = 4.5.31)
进口	方法
链接
建议	testthat，BiocGenerics，BiocStyle，knitr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/phaverty/bigmemoryExtras
全靠我
进口我	gCMAP
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	bigmemoryExtras_1.28.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	bigmemoryExtras_1.28.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bigmemoryExtras
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/bigmemoryExtras
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/bigmemoryExtras/
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